MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Fusobacterium sp. 4_8 plasmid

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021277	T	9	9	4	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021277	ATTTT	2	10	55	64	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021277	TTC	2	6	83	88	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021277	ATTT	2	8	98	105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021277	T	6	6	103	108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021277	TATT	2	8	269	276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021277	TAAA	2	8	294	301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021277	AAAAT	2	10	319	328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021277	TA	3	6	335	340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021277	GTA	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021277	T	8	8	424	431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021277	TAA	2	6	437	442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021277	ATT	2	6	471	476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021277	TGTAC	2	10	492	501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021277	ATT	2	6	605	610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021277	CAA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021277	ATTT	2	8	671	678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021277	T	6	6	685	690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021277	A	7	7	693	699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021277	TTA	2	6	4312	4317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021277	AAC	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021277	TAT	2	6	4383	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021277	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021277	ACT	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021277	AATC	2	8	4534	4541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021277	ATTTA	2	10	4599	4608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021277	TAC	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021277	ATT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021277	ATTT	2	8	4651	4658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021277	TTTAA	2	10	4662	4671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021277	ATA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021277	ATA	2	6	4694	4699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021277	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021277	ATTTT	2	10	4768	4777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021277	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021277	AT	4	8	4787	4794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021277	AT	3	6	4803	4808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021277	TCA	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021277	AT	3	6	4901	4906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021277	AT	3	6	4911	4916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021277	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021277	T	6	6	4930	4935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021277	ATCA	2	8	4951	4958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021277	T	7	7	4974	4980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021277	AT	3	6	4987	4992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021277	A	6	6	5021	5026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021277	TTGA	2	8	5242	5249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021277	TAAT	2	8	5277	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021277	TCAA	2	8	5914	5921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021277	TA	3	6	5922	5927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021277	A	6	6	5927	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021277	TA	3	6	6652	6657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021277	AT	3	6	6668	6673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021277	TA	3	6	6688	6693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021277	GAA	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021277	A	6	6	6731	6736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021277	T	8	8	6757	6764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021277	A	6	6	7691	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021277	TCAA	2	8	7703	7710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021277	GA	3	6	7725	7730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021277	TAT	2	6	7769	7774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021277	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021277	A	6	6	7813	7818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021277	T	6	6	7819	7824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021277	TCTT	2	8	7840	7847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021277	TGT	2	6	7883	7888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021277	TAA	2	6	7912	7917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021277	A	6	6	7916	7921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021277	TAA	2	6	7925	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021277	AGG	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021277	AAT	2	6	7967	7972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021277	A	6	6	8238	8243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021277	TAA	2	6	8246	8251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021277	A	7	7	8259	8265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021277	T	8	8	8287	8294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021277	TAT	2	6	8321	8326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021277	CTTTT	2	10	8331	8340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021277	ACC	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021277	AGT	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021277	TATT	2	8	8397	8404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021277	AT	3	6	8419	8424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021277	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021277	ATTTT	2	10	8450	8459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021277	ATA	2	6	8475	8480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021277	TCCA	2	8	8498	8505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021277	AGG	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021277	TAA	2	6	8563	8568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021277	TTA	2	6	8577	8582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021277	TTAATT	2	12	8611	8622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021277	AATT	2	8	8627	8634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021277	T	6	6	8680	8685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021277	ACC	2	6	8734	8739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021277	TTA	2	6	8744	8749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021277	GCTAT	2	10	8764	8773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021277	T	6	6	9130	9135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021277	T	8	8	9179	9186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021277	CCA	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021277	TAG	2	6	9217	9222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021277	AGA	2	6	9236	9241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021277	TTTA	2	8	9268	9275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021277	T	6	6	9322	9327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021277	A	8	8	9341	9348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021277	TAT	2	6	9351	9356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021277	T	7	7	9379	9385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021277	T	6	6	9403	9408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021277	A	6	6	9425	9430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021277	TTTA	2	8	9462	9469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021277	T	6	6	9480	9485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021277	TA	3	6	9530	9535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021277	AAT	2	6	9552	9557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021277	AT	4	8	9563	9570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021277	A	7	7	9607	9613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021277	TA	4	8	9621	9628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021277	T	7	7	9630	9636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021277	A	6	6	9676	9681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021277	T	6	6	9699	9704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021277	AT	3	6	9726	9731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021277	A	8	8	9748	9755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021277	CAAAA	2	10	9766	9775	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021277	T	6	6	9781	9786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021277	A	7	7	9787	9793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021277	A	7	7	9805	9811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021277	ACT	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021277	A	6	6	9863	9868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021277	A	6	6	9877	9882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021277	AAT	2	6	9891	9896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021277	A	6	6	10235	10240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021277	TA	4	8	10241	10248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021277	A	7	7	10257	10263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021277	AGT	2	6	10275	10280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021277	ATA	2	6	10301	10306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021277	AAC	2	6	10318	10323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021277	TTTC	2	8	10336	10343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021277	TGT	2	6	10352	10357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021277	TAT	2	6	10361	10366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021277	AT	3	6	10380	10385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021277	TA	4	8	10402	10409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021277	TTC	2	6	10426	10431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021277	T	6	6	10445	10450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021277	TTTA	2	8	10468	10475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021277	T	6	6	10503	10508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021277	TAAAG	2	10	10516	10525	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021277	A	6	6	10532	10537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021277	GA	3	6	12412	12417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021277	AAC	2	6	12418	12423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021277	TGA	2	6	12456	12461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021277	A	7	7	13612	13618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021277	TA	3	6	13623	13628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021277	ATA	3	9	13626	13634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021277	CTTTT	2	10	13638	13647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_021277	T	6	6	13644	13649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021277	TATT	2	8	14016	14023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021277	TAAA	2	8	14041	14048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021277	AAAAT	2	10	14066	14075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021277	TA	3	6	14082	14087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021277	GTA	2	6	14104	14109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021277	T	8	8	14172	14179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021277	TAA	2	6	14185	14190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.